Bilgisayar bilimleri ile mikrobiyolojiyi buluşturan A. Murat Eren, biyoenformatik alanında dünya çapında çalışmalar yürütmektedir. Bilim dünyasında Meren lakabıyla da bilinen bir isimdir. Yenilikçi ve açık kaynaklı yazılımlar geliştiren Eren, mikrobiyal ekolojideki büyük veri setlerinin çözümlenmesini kolaylaştırarak karmaşık mikroorganizma topluluklarını incelemektedir. 1980 yılında dünyaya gözlerini açan başarılı araştırmacı, çocukluk yıllarını Artvin'in Yusufeli ilçesine bağlı Barhal köyünde geçirdi.
Artvin'den Amerika'ya Uzanan Akademik Yolculuk
İlk gençlik yıllarının ardından yükseköğrenim için Çanakkale'ye giderek buradaki Onsekiz Mart Üniversitesi bilgisayar mühendisliği bölümüne girdi. Bu bölümden 2002 senesinde mezun oldu. Yüksek lisans eğitimi döneminde Türkiye'nin milli işletim sistemi Pardus projesinin çekirdek geliştirici kadrosunda görev aldı. Bilgisayar sistemleri ve ağları üzerindeki bu ilk tecrübeleri, onun ilerideki büyük veri çalışmalarına zemin hazırladı. Akademik hedeflerini büyütmek isteyen bilgisayar mühendisi, yüksek lisans sonrasında Amerika Birleşik Devletleri'ne yerleşti. Burada New Orleans Üniversitesi bünyesinde doktora çalışmalarına başladı ve farklı projelerde çalıştı. Araştırmacının New Orleans Çocuk Hastanesi bünyesinde yürüttüğü çalışmalar esnasında Michael Ferris ile yollarının kesişmesi, onun bilgisayar bilimleri alanından mikrobiyoloji dünyasına yönelmesinde son derece belirleyici bir dönüm noktası teşkil etti.
Büyük Verinin Analizinde Çığır Açan Araçlar
Nükleotit varyasyonları aracılığıyla mikrobiyal çeşitliliğin analizini konu edinen tezini tamamlayarak 2011 yılında doktor unvanını kazandı. Eren'in doktora tezi, mikroorganizma çeşitliliğini nükleotit dizilimlerindeki değişimler üzerinden analiz etmeye odaklanmıştı. Bu çalışma araştırmacıya yepyeni kapılar açtı. Doktora derecesini aldıktan sonra akademik kariyerine saygın kurumlarda devam eden Eren, aynı zamanda önemli bilimsel araştırma merkezlerinde kritik görevler üstlendi. Araştırmacının kariyerindeki önemli kurumsal duraklar ve dahil olduğu projeler şu şekilde sıralanabilir:
- Türkiye'nin milli işletim sistemi Pardus projesi çekirdek geliştirici ekibi
- ABD'deki New Orleans Çocuk Hastanesi araştırmaları
- Biyoenformatik çalışmalarını yürüttüğü Chicago Üniversitesi
- Mikrobiyal ekoloji araştırmaları yaptığı Marine Biological Laboratory
Mikrobiyal toplulukların karmaşık genetik yapılarını ve çevreleriyle olan etkileşimlerini detaylıca incelemek amacıyla laboratuvarında geliştirdiği yenilikçi açık kaynaklı yazılımlar, günümüde dünya genelindeki pek çok biyolog tarafından aktif olarak kullanılmaktadır. Meren Lab adı altında kurduğu araştırma grubuyla birlikte biyoenformatik alanındaki yenilikçi çalışmalarını sürdürmektedir. İnternet dünyasında çalışmalarını meren.org adresinden paylaşmaktadır. Mikroorganizmaların gizemli dünyasını anlamak için geliştirdiği yöntemler ekoloji araştırmalarına ışık tutmaya devam ediyor.