Türk futbolunun yetenekli isimlerinden Emre Aygün, 1 Haziran 1985 tarihinde Trabzon'da dünyaya gözlerini açtı. Futbol tutkusu genç yaşta başladı. Trabzon'un yerel amatör ekiplerinden olan 24 Şubatspor'un altyapısında futbol eğitimine başlayan Aygün, sergilediği yüksek yetenekle kısa zamanda şehrin büyük temsilcilerinin gözlemcileri tarafından keşfedildi. Genç futbolcu, 2000 yılında şehrin en büyük temsilcisi olan Trabzonspor'un altyapısında gelişimini sürdürmek üzere transfer olarak kariyerinde dev bir adım attı. Profesyonelliğe adım atması uzun sürmedi. Trabzonspor ile 2003 yılında profesyonel sözleşme imzalayarak as takım kadrosuna katılma başarısını gösterdi.
Trabzonspor Yılları ve Kiralık Dönemler
Trabzonspor formasıyla ilk heyecanını 27 Nisan 2003 tarihinde Göztepe karşısında yaşayan sporcu, Süper Lig sahnesine resmen adım atmış oldu. Teknik kadro, genç oyuncunun daha fazla maç tecrübesi kazanmasını ve kendisini geliştirmesini hedefliyordu. Bu doğrultuda genç yetenek, 2004-05 futbol sezonunda Yozgatspor bünyesine kiralık oyuncu sıfatıyla dahil edildi. Yozgat macerasının ardından, bir sonraki sezon olan 2005-06 döneminde bu kez Akçaabat Sebatspor kadrosuna kiralık olarak dahil oldu. Bu kiralık dönemler ona tecrübe kazandırdı.
Süper Lig'de Transfer Rüzgarları
Kariyerinde yeni bir sayfa açmak isteyen Emre Aygün, 2006-07 sezonunda bonservisiyle birlikte Akçaabat Sebatspor'a transfer oldu. Kırmızı-beyazlı ekipte bir yıl geçirdikten sonra, ertesi sezon kiralık olarak Orduspor'un yolunu tuttu. Ayrıca Karadeniz temsilcisinde geçen bir senelik sürecin ardından yeniden Sebatspor'a dönen Aygün, burada da bir sezon boyunca ter döktü. Gelişmelerin ardından, 2009-10 futbol sezonunda oyuncunun yeni adresi başkentin güçlü ekiplerinden MKE Ankaragücü olarak belirlendi. Başkent ekibinde beklediği süreyi bulamayarak sadece 10 Süper Lig karşılaşmasında sahaya çıkma fırsatı elde eden yetenekli oyuncu, sezonun tamamlanmasıyla birlikte takımla yollarını ayırma kararı aldı.
Yeni bir macera için Eskişehirspor ile el sıkışan deneyimli futbolcu, kırmızı-siyahlı ekipte yarım sezon mücadele etti. Kırmızı-siyahlı kulüple yollarını karşılıklı anlaşma yoluyla ayıran Aygün, hiç vakit kaybetmeden Ankara'nın köklü futbol temsilcilerinden Gençlerbirliği ile yeni bir sözleşme imzalayarak yeşil sahalardaki kariyer yolculuğunu kesintisiz sürdürdü.
Ay-Yıldızlı Forma Altında Başarılar
Emre Aygün, kulüp kariyerinde gösterdiği grafikle milli takım antrenörlerinin de radarına girmeyi başardı. Farklı yaş kategorilerinde toplam 25 defa milli takımlara çağrılan başarılı futbolcu, ayrıca bu süreşte önemli uluslararası turnuvalarda boy gösterdi. Oyuncunun milli takımlardaki istatistikleri ve başarıları şunlardır:
- Milli takımlar düzeyinde toplamda 25 kez aday kadroya davet edilmiştir.
- Türkiye U-18 takımının formasını 3 kez terletmiştir.
- Türkiye U-19 takımıyla ise tam 18 kez sahaya çıkmıştır.
- Genç milli formayla oynadığı müsabakalarda rakip fileleri toplam 4 kez havalandırmıştır.
- 2004 yılında Türkiye 19 yaş altı milli futbol takımı kadrosunda yer alarak Avrupa 19 Yaş Altı Futbol Şampiyonası İkincisi unvanını elde etmiştir.
Milli formayla sergilediği performans, onun Türkiye'nin o dönemki en önemli genç yetenekleri arasında anılmasını sağladı. U-19 takımıyla büyük başarı kazandı.