Kızlar Sarayı, Amasya'da beş adet Kaya Mezarları ve Kral Mezarlıklarının bulunduğu özel bir bölgenin içerisinde yer almaktadır. Bu tarihi alan; Helenistik Çağ, Roma, Bizans Dönemleri ile Orta Çağ sur duvarlarını da kapsamaktadır.
Arkeolojik Bulgular ve Çalışmalar
Bölgede gerçekleştirilen son dönemlerdeki arkeolojik kazılarda; Roma, Doğu Roma (Bizans), Selçuklu ve Osmanlı dönemlerine ait çeşitli kalıntılar açığa çıkarılmıştır. Alandaki bilimsel kazı çalışmaları günümüzde de halen devam etmektedir.
Sarayın Tarihi Sakinleri
Saray, tarih boyunca son derece önemli hanedan üyelerini ağırlamıştır. Selçuklu Sultanı I. Mesud hayatını bu sarayda sürdürmüştür. Ayrıca bu saray, 150 yıldan fazla bir sürede Osmanlı şehzadelerine, hatunlarına ve valilerine yaşam alanı olmuş ve 1852 yılına kadar bu özelliğini korumuştur.
Günümüze Ulaşan Kalıntılar
Saray kompleksinden günümüze sadece iki adet hamam kalıntısı ulaşabilmiştir. Bununla birlikte, sarayın "Ceylan Yolu" olarak bilinen gizli geçidinin ve yolunun bir bölümüne de günümüzde ulaşılmış durumdadır.